見た目は赤ちゃん、中身はおっさんだった＜ボス・ベイビー＞のテッドは成長し、正真正銘のエリート社長に。一方、兄のティムはタビサとティナという2人の娘に恵まれ、専業主夫として幸せな家庭を築いていた。すっかり疎遠になっていた2人は、久々に再会してもすぐに喧嘩を始める始末。そんな彼らを見かねたまだ赤ちゃんのティナが、2人に突如語り掛ける。「ワタシもボスなの。ベイビー社から新たな任務を伝えに来たわ」悪の天才博士が、赤ちゃんを操り世界征服を企んでいると聞いたテッドとティムは、スーパーミルクで赤ちゃんに戻って再びコンビを結成し潜入捜査に突入！家族を世界を救うため、彼らは史上最大のミッションを達成できるのか？！
監督： トム・マクグラス
出演： （声の出演）：ムロツヨシ、多部未華子、芳根京子、宮野真守、乙葉、石田明（ＮＯＮ ＳＴＹＬＥ）
